Taani naaritsad ja kaduv kohv ning šokolaad

Columbia Ülikooli viroloog Angela Rasmussen kirjutas täna natuke hirmutavatest meediapealkirjadest, mille tingisid Taani naaritsakasvatustest leitud viirusjuhud. Rasmussen on palju püüdnud meedias teha viroloogiat puudutavat infot lihtsamalt mõistetavamaks ja seega ka ülemäärast hirmu vähendanud.

Mis mind tänases postituses köitis, oli tähelepanek, et metsloomadelt võib (aga ei pruugi) viirus kanduda kassidele ... ja kassid on kõikjal 😟😟😟. Rasmussen mainib, et karusloomakasvatuse lõpetamine on igal juhul hea otsus.

☝☝☝ 

So you may have heard concerns about the mink variant of #SARSCoV2 that was discovered in Denmark and is leading to the decision to cull all farmed minks in the country.

This should not be a cause for panic.https://t.co/EMTufmvl4U

— Dr. Angela Rasmussen (@angie_rasmussen) November 5, 2020

Rasmussen kirjutab: Võite olla kuulnud murest Taanis avastatud #SARSCoV2 variandi pärast naaritsatel, mille tulemuseks on otsus kõik riigis kasvatatud naaritsad tappa. See ei tohiks põhjustada paanikat.

https://www.nytimes.com/2020/11/04/health/covid-mink-mutation.html

See on veel üks kehv näide andmete jagamisest pressiteate vahendusel ja pealtnäha kõlavad murettekitavd väited: -inimesed nakatusid sellega –inimesetel on nõrgad antikehareaktsioonid -Taani rahvatervise ametnik ütles, et see tüvi häirib vaktsiini efektiivsust.

Nende väidete toetamiseks pole andmeid, nii et neid on raske hinnata. Kuid me teame veel mõnda asja, mis võib muret veidi leevendada. Hollandis olid selle aasta alguses suured puhangud naaritsafarmides.

https://www.reuters.com/article/us-health-coronavirus-netherlands/netherlands-to-close-mink-farms-after-coronavirus-outbreaks-idUSKBN25N2W2

Hollandi naaritsafarmid olid tõenäoliselt antroponootilise leviku tulemus (inimestelt naaritsatele). Arvatakse, et vähemalt 2 inimest on SARS-CoV-2 nakatunud zoonootiliselt (naaritsatelt inimesele). Seega pole üllatav, et ka Taanis olid taolised juhtumid.

https://www.nationalgeographic.com/animals/2020/11/denmark-mink-culling/

Naaritsatega seotud tuhkruid kasutatakse COVID-19 katsemudelina (noh, pigem nagu SARS-CoV-2 nakkuse mudel, sest tuhkrud ei haigestu eriti). Seega pole šokeeriv, et naaritsad on nakkustele vastuvõtlikud.

Siiani pole olnud andmeid, mis näitaksid, et naaritsast saadud variantidest põhjustatud COVID-19 erineb oluliselt inimestest saadud variantidest. "Nõrgad" antikehareaktsioonid ilmnevad ka kergetel või asümptomaatilistel COVID-19 juhtudel.

Nüüd jõuame kõige murettekitavama väite juurde, et naaritsast saadud viirused muudavad vaktsiinid vähem tõhusaks.  

Kuid teadmata, millised need mutatsioonid on, on ebaselge, mis on selle mõju vaktsiinidele. Seni, kuni mutatsioonid pole antikehade neutraliseerimiseks olulistes piigi (piikvalk) piirkondades (nn neutraliseerivad epitoopid), on see vaid spekulatsioon.

Isegi kui teadaolevates neutraliseerivates epitoopides on mutatsioone, on see ikkagi spekulatsioon. Mutatsiooni funktsionaalse efekti ennustamiseks võite kasutada kõiki oma tööriistakasti väljamõeldud arvutuslikke ja struktuurseid modelleerimisnippe, kuid tegelikult ei tea te seda enne, kui katsetate seda eksperimentaalselt.

Lisaks muteeruvad sellised RNA viirused nagu SARS-CoV-2. See on normaalne ja oodatud. Me juba teame, et mis tahes mutatsioon, olenemata sellest, kas see on pärit inimesest või naaritsast, võib esineda olulises epitoopis.

Mutatsioonid on muutused RNA genoomis. Kui need esinevad viiruse valku kodeerivas genoomi osas, võib see põhjustada selle, et sellesse valku sisestatakse erinev aminohape kui algselt kodeeritud aminohape. See võib mõjutada antikeha seondumist selle epitoopiga

Antikehad on peenelt spetsiifilised ja mõnikord võib isegi üks aminohappe asendus tühistada antikeha seondumise. Seega võib mutatsioon võtmeepitoobis tähendada, et ühe variandi vastu kasvatatud vaktsiinid tekitavad antikehi, mis ei kaitse mutatsiooni sisaldavate variantide eest.

Kuid nad pole näidanud, millised mutatsioonid on naaritsa saadud variandid omandanud, nii et kes teab? Mutatsioonid tekivad ka inimpäritoluga viirustes, nii et loo moraal seisneb selles, et pääsemisvariantide otsimiseks peame kõigi ringlevate SARS-CoV-2 isolaatide korral läbi viima tugeva seire.

Nii et pole mingit põhjust nende naaritsa variantide pärast eriti muretseda, kui pole muid tõendeid. Peaksime andmed, kui need on kättesaadavad, objektiivselt üle vaatama, ning jätkama ja laiendama genoomset seiret.

Taani võimud ei tegele asjaga, mille pärast mina kõige rohkem muretsen: uus reservuaariliik. Kui SARS-CoV-2 hakkab metsloomadel ringlema, siis on meil oht, et nende uute reservuaaridega kokkupuutel tekivad tulevikus zoonootilise leviku tagajärjed.

Olen juba väga mures selle pärast, et SARS-CoV-2 võiks kassidel kinnistuda. Kassid on nakkustele vastuvõtlikud ja USA- on miljoneid  (ja miljoneid ka mujal maailmas) metsikuid kasse. Kui kassidest saab väljakujunenud reservuaar, võime olla SARS-CoV-2-ga seotud aastaid.

Sellega seoses on hea, et Hollandi naaritsatootmine suletakse aastaks 2021 täielikult. Loodetavasti järgivad seda ka teised riigid. Naaritsakasvatus on samuti ebavajalik ja julm, nii et selle tava jätkamiseks on vähe toetavaid tegureid, seda enam, kui  on ka kõrvalmõju oht.

Aga ma tõesti soovin, et teadust ei antaks edasi pressiteate abil. Pole mingit põhjust, miks genoomiga seotud andmeid ei saaks jagada, mis võimaldaks teadusringkondadel neid väiteid hinnata. Kui te pole andmeid näinud, on riski raske hinnata.

LISA: Jah, ma tean vahet Madalmaade ja Taani vahel. Kui ütlesin, et Hollandis naaritsatööstus lõpetatakse aastaks 2021, pidasin silmas Madalmaade naaritsakasvatust. Ma ei tea, kas naaritsakasvatus Taanis lõpeb pärast loomade tapmist.

Loomadega on ühesõnaga kehvasti ja taimedel ei lähe paremini.  

Henner Townlove kirjutab oma artiklis, et üheksakümmend üheksa koma üheksa protsenti (99,9%) kõigist Maal kunagi eksisteerinud liikidest on nüüdseks välja surnud. Enamik neist hukkus Maa ajaloo viies kataklüsmilises sündmuses; ja hiljutise teadusküsitluse järgi arvab seitse bioloogi kümnest, et oleme kuuenda massilise väljasuremise küünisel. Isegi tänapäeval on taimeliike, mis on väga sõltuvad teatud tüüpi keskkonnateguritest, nagu temperatuur, vesi ja kõrgus, nii et kui mõnes neist esineb häireid, arenevad nad lõpuks halvasti või ei suuda üldse kasvada. Meie huvides on vältida nende ohustatud põllukultuuride väljasuremist, sest osad neist on tihedalt põimitud meie igapäevaelu kangasse.

Maa soojeneb

Kliimamuutused on tõsine küsimus, mida tuleb võimalikult kiiresti lahendada. Alloleval pildil on temperatuuri erinevused üleilmse viie aasta keskmistest kolmel erineval aastal. Kui teie riik on punases, tähendab see, et teie riigis on selle 5-aastase ajavahemiku jooksul keskmine temperatuur rohkem kui 4 kraadi kõrgem.

Ülaltoodud pilt annab võimaluse võrrelda, kuidas on  aastakümnete jooksul suuremad temperatuurimuutused toimunud. Kõige drastilisemaid muutusi kogevad põhjapooluse lähedal asuvad alad. Maa muutub lihtsalt üha soojemaks. See temperatuuri tõus võib otseselt või kaudselt mõjutada tundlikke põllukultuuriliike, mis kasvavad ainult kindlates piirkondades.  

Põllukultuurid, mis lähema aastakümne jooksul kaovad:

Kohv

Maailm tarbib palju kohvi, peamiselt selleks, et üles ärgata ja oma töötundidel erksam olla. Selle tarbimist on seostatud nii südame-veresoonkonna haiguste, II tüüpi diabeedi, Alzheimeri tõve kui ka Parkinsoni tõve vähenemisega. Kohvipuud (Coffea), mis meile meie kohvi annab, on eriti raske kasvatada. On kaks peamist sorti, Robusta ja Arabica. Robustad on kibedad, tugevad ja suurema kofeiinisisaldusega. Arabica kohvid on mahedamad, magusama maitsega ja vähem kofeiini sisaldavad kohvid, Starbucksis maksate hea kohvi eest päris palju. Arabica on hea kraam, kuid see on eriti tundlik keskkonnamuutuste suhtes. Arabica marjad kasvavad ainult temperatuuril 18 ° C (64,4 ° F) kuni 21 ° C (69,8 ° F), ning ükskõik milline muu temperatuur ei võimalda marjadel  korralikult areneda. Taim vajab õitsemiseks ja marjade tootmiseks ka palju vihma ja kolmekuulist kuivaperioodi. Kõigi nende tegurite tõttu kasvab Araabika 1000–2000 meetri kõrgusel merepinnast troopilistes piirkondades vahemikus 25 ° N kuni 30 ° S.

 

Kuid kliimamuutuste korral on temperatuure, vihmaperioodi ja ka kuiva hooaega dikteeriv tsükkel segaduses. Nii palju, et on ennustatud, et kliimamuutused vähendavad Araabika kohvi tootlikkust 2050. aastaks poole võrra. Temperatuuri tõus võimaldab nendes taimedes levida ka seenhaigusel. Sestap selle ühiskonna üliolulise komponendi äravõtmine võib põhjustada teatud tagajärgi. Kultiveerijad võitlevad kõvasti nende taimede elus hoidmise nimel, kuid see võib olla ette kaotatud võitlus, eriti siis, kui me ei teadvusta kliimamuutuse probleeme.

 

Šokolaad

Šokolaad sisaldab palju antioksüdante ja väidetavalt vähendab südame-veresoonkonna haigusi ja parandab vaimset funktsiooni. Kogu šokolaadi saame kakaopuult. Kakaokauna kuivatatud ja kääritatud seemned (oad) läbivad täiendavaid protsesse šokolaadi erinevate tootesortide loomiseks. Kakaopuud sarnanevad kohviga selle poolest, et nad kasvavad ekvaatori lähedal - ca 20 kraadi sellest ülal ja allpool. Samuti vajavad ka nemad korralikuks kasvamiseks konkreetseid tingimusi. Kakaopuud eelistavad tegelikult suhteliselt kõrgeid temperatuure, maksimaalne aastane keskmine temperatuur on 30–32ºC ja minimaalne keskmine 18–21ºC. Temperatuuri tõus ei mõjuta neid taimi küll otseselt, kuid seda teeb sademete vähesus. Aastaste ilmastikutingimuste suured muutused häirivad kakao tootmist. Puud on väga tundlikud aurustumist läbi viiva niiskuse ja pinnase veepuuduse suhtes. Need taimed vajavad tuule eest kaitsmiseks ka kõrgemate puude seltskonda ja see annab neile hädavajaliku varju, mis meenutab nende algseid elutingimusi Amazonases. Liiga palju vihma ei ole alati hea, vihmaperioodi pikendamine enamikus Lõuna-Ameerika piirkondades võib olla väga soodne seenhaiguste, nagu Witches’ broom ja frosty pod, levikuks - seda tüüpi haigused hävitasid Kesk-Ameerika kakaoistandusi.

Praegu toodab Lääne-Aafrika üle poole maailma šokolaadivarust, mida omakorda ähvardab üha enam põud. Prognoositakse, et sarnaselt kohviga väheneb maailma šokolaadivarustus aastaks 2050 oluliselt. Loodan kindlasti, et leiame selleks ajaks sõbrapäevale sobiva asenduskingituse. Lootus pole siiski kadunud, ka siin töötavad kultivaatorid ööpäevaringselt mitmesuguste aretustööde nimel, et toota resistentset šokolaadi, mis võiks päästa kakaopuu. 

Avokaado

Avokaadosid kutsuti algselt āhuacatl, mis tähendab munandit, kuid see tundus ebameeldiv ja raske hääldada, nii et nad tegid täiesti uue sõna - seega avokaado. Avokaadod näivad olevat tänapäeval asendamatud. Inimesed panevad neid röstsaiadesse, burritodesse, sushidesse ja peaaegu kõigesse, mis pähe tuleb. Selle kaunis erkroheline värv koos teiste toitude taustadega on väga populaarne. Arvatakse, et avokaados olevad monoküllastumata rasvhapped vähendavad halva kolesterooli taset, suurendades samal ajal head. Nõudlus avokaado järele tõusis esimest korda 1990. aastatel ja on sellest ajast alates jätkuvalt kasvanud. Isegi praegu tarbitakse kogu maailmas aastas umbes 11 miljardit naela. Sellel “superpuuviljal” on siiski varjukülg. Avokaadosid on väga raske kasvatada, arvestades, et nad vajavad tonnidega vett. Tšiili kogukonnad on kaotanud oma jõed tänu sellele, et suunavad vett avokaadoistandustesse. 

Põhja-Ameerikas on poest ostetud avokaadod enamasti pärit Californiast, Mehhikost, Peruust, Tšiilist ja Dominikaani Vabariigist. Avokaado on janune puuvili. Kilogrammi avokaado kasvatamiseks on vaja rohkem kui tuhat liitrit vett. Meie suur nõudlus selle puuvilja järele on nõudnud kallist hinda, keegi ei tea seda paremini kui Petorca inimesed. Petorca on Tšiili linn, mis on kaotanud 80% veest põllumajanduse tõttu – seda peamiselt avokaadode kasvatamiseks. Samuti vajavad avokaadod õitsemiseks stabiilset temperatuuri, umbes 15–29 ºC. Kuid kui nad on kasvama läinud, suudavad puud taluda isegi madalamaid temperatuure kuni -2 ºC. Kliimamuutused on avokaadodele probleeme toonud. Globaalsed temperatuuritõusud on oluliselt vähendanud avokaadofarmidesse tulevate veevarude hulka. Keskmised temperatuurid tõusevad Mehhikos kliimamuutuste tõttu aastaks 2060 eeldatavasti 3 °C võrra. Californias on pidev kuiv ilm põhjustanud intensiivseid tulekahjusid ja osariigi veevarustuse vähenemist, mis omakorda mõjutab nii veinitehaseid kui ka avokaadofarme; kultivaatorid lihtsalt ei suuda sammu pidada. Pidev nõudmine avokaadode järele on põhjustanud Mehhiko keskosas suuri metsaraieid, mis veelgi teravdavad kliimamuutusi. Kahjuks on meie endi vaibumatu nälg avokaadode järele olnud kõige hullem. Keskendumine teistele toiduvalikutele võib neid probleeme leevendada ja päästa nii Petorca kui ka Mehhiko männimetsad. Kui me praegu ei tegutse, oleme kindlasti omadega metsas. 

Banaanid

Monokultuur on ühe kultuuri kasvatamine teatud piirkonnas. Mis viib meid banaaniistandustesse, iseenesest ei ole tegemist istandusega, kuna banaanitaimel ei ole otseseid järglasi, vaid kõik banaanid on kloonid, millel on sama geneetiline koostis - ehk see on sama banaan. Veel ühe banaani tootmiseks lõigatakse algse banaani küljest varretükk ja  kinnitatakse maapinnale. Kõigi banaanide hulgast kõige tavalisem on Cavendishi banaan. See konkreetne banaan domineerib turul niivõrd, et see on tõenäoliselt ainus banaan, mida oma toidupoest leiate. Kui peaksite minema banaaniistandusse, on suur tõenäosus, et kõik neist banaanidest on Cavendish´id. Tegelikult on mis tahes banaaniistandustes geneetilist mitmekesisust väga vähe, nii et kui seenhaigus tapab ühe banaani, võib see lihtsalt hävitada kõik banaanid sellel põllul. Cavendishi banaane imporditakse Põhja-Ameerikasse peamiselt Lõuna-Ameerika istandustest.

Enne Cavendishi valitsemisaega oli veel üks laialdaselt kasvatatud banaan, see oli Gros Michel, kuid need banaanid hävinesid 1950. aastatel Panama tõve tõttu, seega ei näe tänapäeval neid banaane eriti palju. Haigust põhjustav seen on Fusarium oxysporum Tropical Race 1 tüvi või TR1, õnneks on Cavendish selle seene suhtes immuunne, kuid sellel seenel on tekkimas uus tüvi TR4, mille vastu Cavendish pole immuunne ja see on tekitanud kaose Aasias Cavendish populatsioonides. On ainult aja küsimus, millal see seen Lõuna-Ameerikasse jõuab.

Ka banaani ajalugu on üsna “banaanine”. Tekkis palju konflikte, eriti Lõuna-Ameerikas, ja banaanifirmade otsese mõju tõttu on tapetud päris palju inimesi. Just siit sündis mõiste “banaanivabariik”. Banaanid on täis kaaliumi - mineraalset elektrolüüti, mis hoiab töös kogu keha voolu, mis on vajalik teie südame tukslemiseks. Banaan on siin sellesse nimekirjas viimane, sest globaalse temperatuuri tõus ei mõjuta neid eriti negatiivselt, tegelikult armastavad banaanid soojemat temperatuuri, kuid Panama haigust põhjustav seen on tõeline oht, mis tähendab, et kui seda ei suudeta kontrollida, siis on banaanid peagi minevik. Üks pisitilluke TR4 mikroskoopiline eos on piisav, et kogu riigi banaanivarud hävineksid. Ärgem kaotagem veel lootust, käimas on palju pingutusi Cavendishiga resistentsete tüvede ristamiseks. Filipiinide bioloogid on välja töötanud isegi seenele vastupidavad cavendishi tüved, ainus probleem on see, et keegi ei osta neid, sest need ei tundu väljanägemiselt eriti esteetilised (rohkem laigulised). Kuid kui me toime ei tule, muutub banaan varsti haruldaseks luksuseks ja lõpuks hakkame aru saama, et allpool oleval pildil Maurizio Cattelani kunstiteos (mis maksis 150000 dollarit) ei olegi nii absurdne.  

Vihase koka monoloog viiruse ümber käivast trallist.

Veel natuke sapilisust? 

Angry Chef ehk Anthony Warner on biokeemiku kraadiga  25 aastat kokaametit pidanud mees. Siit võid lugeda pikemalt, miks siis kokk nii vihane on :).

Sapine, kriitiline, vihane ja äärmiselt täpne. :)

Olen tahtnud varemgi tema artiklitest midagi tõlkida, kuid tema vandesõnade kollektsioon on üsna mahlane ja paratamatult läheb osa tõlkes kaotsi. 

Ise kirjutab ta, et Angry Chef on pühendunud toidumaailmas levivate valede ja naeruväärsuste paljastamisele. "Olen olnud kokk 25 aastat ja minu suur kirg on toit. Siin, kus nii paljud blogijad, kuulsustest peakokkad, ajakirjanikud, toidukirjanikud, toidutootjad omavahel võitlevad üsna rahvarohke turuniši nimel, räägitakse toidust, mida me sööme valesid iga päev. Ja inimesed, kes toidust valesid räägivad, ajavad mind vihaseks. See ajab mind vihaseks, kuna nad kuritarvitavad midagi, mida ma armastan."

Muidu ta väga vihane välja ei näe:

21. märtsi postituses kirjutab The Angry Chef: 

Mulle ei läinud eriti korda, kui heaolu(wellness)tööstus rikastele inimestele kasutut sitta müüs, lihtsalt ironiseerisin kõrvalvaatajana.

Põhjus, miks ma nii palju aega olen pühendanud toitumisalaste müütide ümberlükkamisele on see, et minu arvates esindab dieedikultus tumedamat, sügavamat halba enesetunnet. Kahjustub teadlikkus. Püütakse idealiseerida minevikku. Ekslikult võrdustatakse naturaalne heaga. Teadusareng lükatakse tagasi kodukootud tõe pärast.

Oma blogi kirjutamise aastate jooksul olen kaevunud tohutusse küülikuurgu. Alustades mõnedest 2016. aasta Instagrami „puhastest“ toitujatest koos Goopi ja Meditsiinimeediumiga on minu viha jõudnud nii professorite, toitumisspetsialistide, arstide, psühholoogide, nii veganite kui ka karnivoorideni. Olen ründanud dieeditööstust, toidulisanditööstust, tervisliku toidu tööstust ja lihatööstust. Siin olid need, kes väitsid end olevat tõenduspõhised praktikud, kuid olid huvitatud ainult oma mõttetute dieediraamatute müümisest. Oli lugematu arv närukaelu, kes olid niivõrd ennast täis, et uskuda, et just nemad oskavad toitumisalast teaduskirjandust paremini tõlgendada kui need komiteed, kelle ülesanne oli seda teha. Välja kasvas täiesti uus tööstusharu, millele viskas tuld alla kogu sotsiaalmeedia ringkond, mis pühendus ekspertteadmiste nõrgestamisele. Ja kogu see trall käis ainult toidu  ja tervise ümber. Olin keskkonna teemaga alles alustanud.

Ja siis tuli Covid-19, mille põhjustas see kuradi loll värdjaviirus. Tappes tuhandeid, halvates tervishoiusüsteeme, sundides meid oma kodudesse varjuma. Oht, mis võib põhjustada peaaegu piiramatuid kannatusi. Pole ühtegi head varianti. Iga valitud tee on täis laipasid. Need, kes otsustavad selliste asjade üle, peavad nüüd valima, milline halvast on vähim halb. See tähendab, et just praegu kaalub keegi kuskil erinevate elude väärtust, otsustades, kes päästetakse ja kelle peame ohverdama. Mul on igavesti hea meel, et inimene, kes neid õõvastavaid otsuseid teeb, pole mina.

Teised, enamasti ilma kvalifikatsioonita ja kogemusteta amatöörid, näivad aga olevat täiesti veendunud, et nemad saaksid paremini hakkama. Insenerid, majandusteadlased, ajakirjanikud ja tehnoloogiaässad loovad oma graafikuid, teevad oma järeldusi ja näitavad kätte parima tee, ilma et neil oleks päevagi kogemust epidemioloogia alal. "Kas te ei saa aru eksponentsiaalsest kasvust", karjuvad nad, saamatu aru, kui irooniline on neist teisi lollideks kutsuda. Nende kohatu kindlus levitab hirmu, tekitab pahameelt ja õhutab paanikat, mis kõik on loodud nende magamistoa mugavusest. Nende kirjeldamatu ülbuse juured tulenevad globaalsest projektist, mis tahab õõnestada traditsiooniliste teadmiste väärtust. Teabe enneolematu demokratiseerimine, mis määratleb meie tänapäevast ajastut, on jätnud meile põlvkonna, kes pole täiesti võimeline mõistma omaenda rumalust. Tarkused ilma arukuseta on mürgine kombinatsioon. See võib varsti surmavaks osutuda.

Kui see põrgu üle meie langeb, heidab see eredat valgust neile, kes on viimastel aastatel tõde väänanud ja sellega manipuleerinud. Gwyneth Paltrow wellness-pask pole enam naljakas, armas ega vabandatav. Goop'i järeleandmatult reklaamitud „Meditsiinimeedium” on jaganud oma näpunäiteid koroonaviiruse vastu võitlemiseks, kahtlemata sellerimahla, mustikate ja muu sellise prügiga. Meid palutakse uskuda, et neid elutähtsaid tervisenõuandeid annab talle tulevikust pärit kummitus, ehkki kummalisel kombel ei suutnud see näha meie praegust epideemiat. See on kõik pentsik ja lõbus seni, kuni mõni õnnetu tohman hakkab uskuma, et ta on surmava viiruse eest kaitstud, kuna maksis ülehinnatud toidulisandite eest 50 dollarit ja läheb oma vanaemale külla.

Mikrobioomi dieedi  alal edu saavutanud geneetik professor Tim Spector jagas hiljuti oma artiklit, soovitades meil kõigil juua keefiri  ja vältida viiruse vastu võitlemiseks töödeldud toitu. Candida dieedi autor ja madala süsivesikusisalduse (low carb) fanaatik  Zoe Harcombe on kirjutanud laialt jagatud ajaveebi postituse, milles räägitakse viirusest, väites enesekindlalt, et teatatud numbrid on valed. Professor Tim Noakes kordas naeruväärset väidet, et "me ei sulge riike gripi tõttu". Kumbki neist pole selle valdkonna ekspert. Mõlemal on sotsiaalmeedais arvestatav järgijate hulk ja nad arvavad, et nende arvamused on kuulamist väärt. Me võime ainult loota, et Trump ei jälgi neid Twitteris.

Kui viimased aastad on meile midagi õpetanud, siis seda, et asi võib alati halvemaks minna. Rahva hinge edasiseks purustamiseks teatas Channel Four, et naftafirma kannupoiss ja ebaõnnestunud restoranipidaja Jamie Oliver täidavad meie telekavades vajaliku lünga, tõstes äsja töötute restoranitöötajate meeleolu igapäevase Corona Virus Cook-Along'iga. Ei ole midagi paremat, kui multimiljonär, kes jagab näpunäiteid kokkuhoidlikkuse osas. 

Järgmisel nädalal aitab prints Andrew tööintervjuudega. Teisipäeval jagab Elon Musk sotsiaalmeedia kaudu nõu uute sõprade leidmiseks läbi sotsiaalmeedia.

Kümned isehakanud toitumisgurud on viiruse vastu võitlemiseks müünud ​​toidulisandeid, leedrimarjaekstrakte või konsultatsiooni alusel väljastatavaid dieedinõuandeid. Karnivooride ja madala süsivesikusisaldusega dieete pakutakse  laialdaselt välja, kui haigestumist ennetatavad. Veganlust on nimetatud kõigi zoonootiliste haiguste lahenduseks. Kuid positiivse poole pealt on sõnapaari "immuunsuse tugevdamine(immune boosting)" esinemine nüüd suurepärane lakmuspaber avastamaks šarlatane.

Selline pask pole ok. See pole kunagi seda olnud, kuid siis oli maailm teistsugune ja murekohaks ainult madala vöökohaga teksased ja teismelised, kes veetsid liiga kaua aega oma telefonides. Praegu on ülemaailmne kuradi pandeemia ja neile teist, kes on mõne viimase aasta jooksul elatist teeninud müües kogu seda heaolu paska, toiduga seotud süütundeid ja imerohtusid, oleks nüüd tõesti hea aeg oma kuradi putka kinni panna. Las arstid, õed ja tõelised teadlased saavad võimaluse oma hääle kuuldavale tuua. Ärge uputage teavet, mis päästab inimeste elud, selleks, et nii oma pseudoteadused ja valed kuuldavaks teha.

Ja seni, kuni  me selleni jõuame, saavad teie seast need, kes on viimased kümme aastat veetnud ründamaks tänapäevast toidusüsteemi, väites, et pika elueaga töödeldud toidud on kogu kurjuse juured, oma arvamused üle vaadata. Võib-olla oleks praegu oma kuradi suu kinni panemine hea asi. Või äkki võtke ühe minuti, et hinnata tänapäevase toidumaailma süsteemi, mida kõvasti kritiseeritakse, kuid hoiab millegipärast miljonid meist toidetuna.

Praegu peame tänama taevast, et meie põllumehed, autojuhid, logistikud, koristajad, tehase ja kaupluse töötajad tapavad end tööga, et saaksime oma kappe täita. Peaksime suutma hinnata pakutavate tervislike, toitainerikkaste, pika elueaga toitude mitmekesisust ja mõtisklema süsteemi üle, mis täidab taldrikuid ajal, mil kümnetele miljonitele inimestele öeldakse ootamatult, et nad peaksid 14 päeva varusid soetama. Supermarketid ja suured tootjad on vaeva näinud ja aeg-ajalt on riiulid olnud tühjad, kuid värske kraami turud ja orgaaniliste köögiviljade kioskid oleksid mõne tunni jooksul tühjad. Ma arvan, et kui asjad normaliseeruvad, ei võeta toidugurude sagedast vingumist konservide, purgitoitude ja külmutatud toodete üle enam tõsiselt. Tootjaid, hulgi- ja jaemüüjaid, kes meid toidavad, kutsutakse kangelasteks õigustatult. Ja me mõistame #JERF-i  (JERF – just eat real food, e. söö tõelist toitu) sõdalaste mõttetusest.

See on uute kangelaste aeg. See on moodsa maailma väärastunud artefakt, et nii paljud meist jumaldavad loodust ja demoniseerivad kõike, mis on inimese loodud. See viirus ja selle põhjustatud haigus on sama loomulikud kui päikeseloojang. Vahendid, mis meid päästavad, sepistatakse teaduse tipptasemel. Geneetiliselt muundatud taimed hakkavad tootma viiruse antikehi, mis aitavad luua vaktsiine. Uusimad geenide redigeerimise tehnikad, mida meie toidusüsteemides demoniseeritakse ja mille vastu võideldakse, aitavad meid lahendustele lähemale. Süstime õnnelikult asju, mida väidetavad keskkonnaaktivistid ohtlikuks tembeldavad, ja meil on vaja seda teha. See on tehnoloogia, mis annab meile lootust. Meie usk loodusesse ja mineviku jäljendamine tähendaks miljoneid enneaegseid, kuid täiesti loomulikke surmasid.

Mingi aja pärast on raske tagasi vaadata ja öelda, et me kõik võiksime elada nagu meie vanavanemad. 1919. aastal tappis Hispaania gripiepideemia umbes 50 miljonit, rohkem kui mõlemas maailmasõjas. Meie sugulased, kes selles suure pandeemia üle elasid või hukkusid, oleksid kõndinud üle klaasikildude, et saada sama turvalist ja usaldusväärset toidutarvet kui meil täna. Nad oleksid imestanud selle tehnoloogia üle, mis võimaldab testida ja isoleerida, suutmata mõista, et mõni päev pärast haiguse tuvastamist oli viiruse geneetilise koodi iga osa järjestatud. Nii paljudele meist nüüd kättesaadavad raviteenused oleksid tollal päästnud kümneid miljoneid inimelusid.

Meie käsutuses on veel palju enam töövahendeid ja nii palju uusi teadmisi. Paljud saavad sellest pandeemiast parema meditsiinilise ravi ja hoolduse kaudu üle. Teised väldivad haigust, kaitsevahendite ja rahvatervise strateegia hämmastavate edusammude tõttu. Miljonid ei vaja haiglaravi, sest nad on kõik tugevamad, tervemad ja paremini toidetud.

Ehk kui asjad tasakaalustuvad, saavad  teadlased ja spetsialistid, kes aitavad seda uut maailma luua, kangelasteks, keda me imetleme. Peame kindlasti rääkima nende lugusid. Kui kogu see pask saab reaalsuseks, nähakse Instagrami toitumisspetsialiste, peibutavaid dieediraamatute autoreid, elustiilieksperte, toidulisandite müüjaid ja moedieetide taganttõukajaid sellistena, kes nad on; kas liigsetena tõeliste probleemide maailmas või rahaahnete oportunistidena, kes nähes inimeste kannatusi võtavad seda põneva turundusvõimalusena. Maailm saab mäletama neid, kes üritasid meid meie kõige pimedamal ajal ära kasutada, ja unustavad need, kellel polnud midagi pakkuda.

Loodan, et kiire kuulsuse  ihalemise asemel,  kasvavad tänase kriisi lapsed üles tahtes olla osa meeskonnast, kes järgmise pandeemia ajal töötab välja uue ELISA testi või purustab rekordajaga vaktsiinikoodi. Omakasupüüdlike tehnikamiljardäride või Ferrari riskifondide tiirutajate asemel tahavad nad ehk olla inimesed, kes arendavad keerulisi arvutimudeleid, mis võimaldavad meil haiguste levikut paremini jälgida ja prognoosida. Või tahavad nad saada arstideks, õdedeks ja tervishoiutöötajateks, reageerides ohule omakasupüüdmatu kangelaslikkusega. Sellistel aegadel on sellised kangelased teravas kontrastis kuulsustega, kes jagavad oma kaubamärgi edendamiseks nartsissistlikke koduvideoid, või maksudest kõrvale hiilivad miljardärid, kes peidavad oma punkreid, tagades samas, et kõik hetkel kasutuks jäänud töötajad vallandatakse ilma palgata.

Mul ei ole sellesse võitlusse eriti palju pakkuda. Rohkem kui kunagi varem kahetsen ma, et biokeemias kraadi omandamise järel, valisin teise tee. Tean, et paljudel inimestel, kellega ma ülikoolis koos käisin, on oskused ja teadmised, mis aitavad. Ainus hea asi, mida ma saan teha, on soovitada selle blogi lugejatel leida üles need, kellel on tõelised teadmised. Peaksime täielikult ignoreerima kõiki neid idiootidest teoreetikud, kellel on pool teaduskraadi, lõpetama nende jälgimise, kes seda katastroofi poliitiliseks mänguks muudavad, ja panema suu kinni kõigil neil, kes meie kannatusi kasu saamiseks ära kasutavad.

Ärge lisage kogu sellelel tulvale veelgi müra. Ärge väitke, et te olete ekspert valdkondades, kus teil puuduvad teadmised. Lõpetage teesklemine, et teate, milline olukord homme välja näeb. Saage aru, et pole ideaalset rada, on ainult üks, mis on kõige vähem halb. Mõistke, et suuri rahvatervisega seotud otsuseid teevad sinust targemad inimesed, kellel on rohkem teavet. Kõigetipuks saage aru ja hinnake seda, et otsuseid langetavad eksperdid ja teadlased on praegu suurema surve all kui keegi teine.  Kui saaksite paremini teha, ei istuks te kodus ega loeks seda kuradi blogi.

Nii et peske käsi, hoidke distantsi  ja kuulake ametlikest allikatest saadud nõuandeid. See viirus läheb maksma palju elusid.  Just praegu tehakse mõned kõige raskemad otsused, mida üldse on võimalik ette kujutada  ja tasakaalu leidmine on äärmiselt keeruline. Vastuvõetud meetmed võivad hõlpsalt jätta 20% meist tööta ja võib maailma viia sügavamasse majanduslangusse kui ükski varasem neist. Kui see just nii läheb, on see ütlemata suur inimlik kulu.

Tasub meeles pidada, et see pole ainus haiguse epideemia, millest me praegu läbi läheme. AIDS on tapnud alates selle esmakordsest ilmnemisest 32 miljonit inimest, sealhulgas 700 000 aastal 2018. aastal. Kuid kui teil on mugavust ja jõukust, on HIV tänapäeval midagi, millega saate üsna lihtsalt ellu jääda ja normaalselt elada. AIDS tapab enamasti vaeseid, puudustkannatavaid ja kõiki, kelle ebaõiglane maailm haavatavaks teeb. Ehkki viirused ise ei diskrimineeri, ei hooli rikkusest või rassist, siis nende põhjustatud haigused sageli diskrimineerivad vägagi. Sama kehtib ka praeguse viiruse kohta, kui laseme sellel ringi lennelda ebaausas maailmas.

Kui rahulikumad ajad kord tagasi pöörduvad ja mingil hetkel see kindlasti juhtub, peame leidma kaastunnet ja pakkuma hoolitsust neile, kellel nii hästi läinud ei ole. Kui me seda ei tee, ületab suurenenud vaesuse tõttu hukkunute arv viiruse põhjustatu. Need meist, kellel on veel tööd, peaksid veenduma, et hoolitseme nende eest, kellel on halvemini läinud. Need, kellel on rikkust, peaksid seda kasutama abistamiseks, mitte nägema ümberkujundatud maailma kui võimalust veel rikkamaks saada.

Viimastel aastatel on kaastunnet ja empaatiat olnud napilt. Maailm peab need asjad uuesti üles leidma, vastasel juhul muutub see veelgi ebaõiglasemaks kohaks. Peame meeles pidama neid, kes meid kõige pimedamatel päevadel ära kasutasid, aga ka tervitama neid, kes meie kõrval meid kaastunde ja lahkusega toetasid. Peame tagama, et tulevik kuuluks neile, kes seda väärivad.

Inimese viroom - viiruste rikas maailm vol I

Mitmed aastad tagasi sattusin Colorado ülikooli prof. Rob Knight mikrobioomi kursusele. Sealt sai alguse minu sügav lugupidamine meie silmale nähtamatute kaaskodanike bakterite vastu. Mikrobioom oma mitmekesisusega on lai ja huvitav teema.

uue koroonaviiruse levimise kiirus ja suremuse määr võrreldes teiste viirustega

Kuidas on aga viroomiga? Viiruste kogukonnaga, mis on veelgi pisem ja veelgi suurema bioloogilise mitmekesisusega. Kuna netiavarustes liigub palju väärinfot (ja ei – uusi viiruseid ei ole vaja laboris toota ega luua – kogu loodus on neid paksult täis), siis ma tooksin siia kokkuvõtteid ja märksõnu Kolumbia Ülikooli viroloogia kursusest. http://www.virology.ws/course/

Vincent Racaniello – Kolumbia Ülikooli mikrobioloogia ja immunoloogia osakonna professor on kirglik viiruste uurija ja märgib: maailmas ei ole midagi lahedamat, kui viirused. Nad on kõige lahedamad. Hämmastavad. Ma armastan neid. Minu nutitelefonis on viiruste pildid. Ma töötan laboris koos nendega juba 38 aastat. Üks eelmisel aastal õppinud tudeng ütles mulle pärast selle kursuse läbimist, et ta ei söö enam midagi ega puutu enam midagi, kuna kardab nakatumist. Kuid ma ei taha, et te viirusi kardaksite. Üks minu eesmärk on, et te saaksite aru, kui imelised nad on.

Kui te tahate aru saada elust,  kui te tahate mõista inimese tervist ja haigusi, siis teil on vaja aru saada viirustest.

Me elame ja liigume sõna otseses mõttes viiruste pilves. Viirused nakatavad kõiki elusolendeid planeedil. Igal elusolendil on viirus, mis teda nakatab. Mitte keegi ei saa põgeneda viirusinfektsiooni eest. Isegi viirusega nakatunud rakkudes on viirused, mis neid nakatavad ja igapäevaselt puutume me kokku, sööme ja hingame sisse miljardeid viiruste osakesi. See tuba on täis viirusi. Õhk on neid täis. 

Kui võtaksime siit proovi, siis suudaksime tuvastada palju erinevaid viiruseid. Kõik pinnad on nendega kaetud. Tasapinnad ja eriti uksekäepide oleks huvitav koht viiruste otsimiseks. Kui sööte toitu, sööte alati viiruseid, kui teil oleks täna olnud lõunaks kapsasalat, siis ka see on putukaviiruseid täis. Putukad ronivad mööda kapsast ja jätavad sinna oma viirused. Kuid need ei tee teile midagi halba ja ei nakata teid. Te olete alati viirustega kontaktis, ei ole viirustevaba aega ega kohta, nad on kõikjal. Veel enam, viiruste genoom on osa meie genoomist.

Ma toon mõne näite, kui palju neid on. Võtame meie ookeanid: maailmavetes on 10³⁰ bakteriofaagide osakesi. Bakteriofaagi osake kaalub 10^-15 grammi (femtogramm). Ainuüksi bakteriaalsete viiruste biomass ületab kõikide elevantide biomassi tuhandekordselt. Et teil tekiks parem ettekujutus – 1 teelusikatäies merevees on mitu miljonit viiruseosakest. Kui te järgmine kord ookeanis ujute ja sõbra poole vett viskate, siis see on nagu viiruse aerosooli pihustamine. Need on täiesti kahjutud ja ei tee teile midagi.

Vaalad on näiteks nakatunud viirustega, mis kuuluvad kalitsiviiruste perekonda. Nad on sugulased viirustega, mis võivad teile anda gastroenteriidi (oksendamine ja kõhulahtisus). Ja peale vaalade  põhjustavad nad lööbeid, ville ja gastroenteriiti ka teistele mereimetajatele. Nakatunud vaalade kaudu tuleb ookeanisse igapäevaselt 10¹³ viiruste osakesi.

Ookeanides töötlevad viirused ümber tohutul hulgal orgaanilist ainet, nii et neil on väga tähtis roll. Rannikuvetes on viiruseid rohkem, kui inimesi Maal. Viirused hoiavad endi käes meie planeedi suurimat geneetilist mitmekesisust.

Veel kainestavaid numbreid. Praegu eksisteerib Maal 10¹⁶ HIV viiruse genoomi. Me teame seda nakatunud inimeste järgi. Nakatunuid on ca 37 miljonit. Me teame, milliseid genoome nad kannavad ja seega saame kergesti teha matemaatilisi arvutusi. Mida aga see number tegelikkuses meile tähendab? Meil on väga efektiivsed ravimid HIV viiruse vastu. Neid on umbes 40 ja nad võimaldavad nakatunutel elada ilma haigeks jäämata.  Ainult et HIV genoomides on juba olemas ka resistentsus nendele ravimitele, kuna mutatsioonid kerkivad pidevalt esile. Ükskõik, kui palju ravimeid me selle viiruse vastu ka ei valmistaks, resistentsus tekib alati. Sellest räägime pikemalt HIV loengus.

Kui paljudel teist praegu on viirusnakkus? Tõstke käed! Te ei taha muidugi tõsta aga fakt on see, et teil kõigil on. Minul ka on. Mis tähendab, et kõigil on tosinaringis erinevaid herpese viiruseid sh herpes simplex, varicella zoster viirus,   tuulerõugete viirus – kui te olete vaktsineeritud, olete seda võibolla vältinud, tsütomegaloviirus, Epstein Barri viirus ja mõned veel. Uuringud on näidanud, et üle 90% ameeriklastel on need viirused olemas. Kui te nad kord saanud olete, ei ole neist võimalik vabaneda. Mulle meeldib öelda, et erinevalt armastusest on viirused kogu eluks ja see on tõsi.

Mul on Instagrammi konto, kuhu ma panen üles viiruste pilte ja inimesed on regulaarselt kirjutanud, et minu arst see ja too ravis mind herpesest terveks. Kahjuks on see vale ja te ei saa herpest välja ravida. Ja me räägime sellest lähemalt herpese loengus.

Me teame juba päris palju mikrobioomist – et meie keha igas osas on bakterid. Ja paljud neist on meile kasulikud. Me hakkame järjest paremini aru saama, kuidas nad seda teevad.  Kuid meil on ka viroom. Meie igas keha osas on viirused: hingamisteedes, seedetraktis, närvisüsteemis, nahal jne. Ka tervel inimesel on kõik need viirused. Ma võiksin teilt proove võtta ja leiaksin teie kehast viirused, kuigi te olete täiesti terved. Ja see ongi väga huvitav. Nad on meile kasulikud, me oleme selle kohta leidnud tõendeid.

Me kasutasime drooni, et koguda vaala hingeõhku. Droon tuli tagasi, tõi meile andmed, me analüüsime neid laboris. Ja seal on palju viiruseid. Nii saame me võtta proove igast maailma paigast. Veidi aega tagasi nägin dokumenti, kus proov võeti Hiina liustikult. Nad kaevasid väga sügavale ja tõid laborisse jää proovid. Seal olevad viirused on 15 000 aastat vanad.

Märkisin enne, et viiruste genoom on meie genoomi osa. Siit pildilt on näha, et inimese genoomis on 3,2 miljardit aluspaari.   Nagu näete on valku kodeerivate geenide osakaal üsna väike – 1,5%. Siin on erinevate ülesannete jaoks erinevad asjad. Aga millele ma tahaksin tähelepanu pöörata on 8,3% lõik  LTR retrotransposoonidega. Ma räägin neist lähemalt järgmistes loengutes, kui lühidalt öeldes, on need  jäänukid retroviirusnakkustest, mis olid kaua aega enne seda, kui meist sai Homo sapiens.

Siin te näete 2017 aasta statistikat inimeste suremuse kohta maailmas. Südamehaigused on esimesel kohal. Ma lisasin nooled sinna, kus mängus on viirused.  HIV on kindlasti kõige selgem neist – ca 1miljon surma 2017 aastal. Teiste haiguste puhul ei ole viirused nii selgelt eristuvad.  Väga suur osa hepatiiti on viiruseline. Ja päris palju kõhulahtisuse ja hingamisteede haiguseid on viiruselised. Ja seetõttu me ka uurime viiruseid väga palju. Kuid me hakkame alles mõistma nende rolli meie ökosüsteemis ja seda, kuidas nad meile kasulikud on.  See tähendab, et me oleme hakanud nägema viiruseid enamana, kui lihtsalt haiguste põhjustajana.

Kõige hämmastavam on vast see, et enamik viiruseid, mis meid nakatavad, ei oma meie tervisele ja heaolule mingit mõju. Ümbritsev õhk on neid täis, me sööme ja joome neid sisse, kuid me ei jää haigeks. Miks siis mitte?

Esimene põhjus on see, et nad lihtsalt läbivad meid.  Washingtoni poodides tehtud uuringu käigus osteti kapsast ja see toodi laborisse analüüsimiseks – otsiti viiruseid.  Tulemused näitasid, et iga portsjon kapsast sisaldas 10⁸ üht putuka viiruseosakest. Tegemist on kapsaussi (Trichoplusia ni) viirusega. Nii et mil te iganes sööte kapsasalatit, saate te selle kaasa. Isegi, kui te kapsa ära keedate, viirus muutub küll inaktiivseks, kuid siiski on ta olemas ja te neelate ta alla. Enamik viiruseid aga lihtsalt liigub läbi meie. Nad ei suuda meie rakkudes paljuneda. Sama käib õhuga sissehingatavate viiruste kohta – nad lihtsalt läbivad meid.

Veel üks uuring analüüsis inimeste väljaheidetes viiruse RNA järjestusi. Kõige levinum viirus inimese väljaheites kannab nime Pepper mild mottle virus (PMMoV)  on taimepatogeenne viirus, mis esineb kogu maailmas põllul kasvatatavatel paprika-, tšilli- ja dekoratiivse pipra liikidel.   

Enamik inimesi sööb paprikat ja paprika viirus võib paprikal olla ilma igasuguste sümptomiteta ja te sööte selle endale sisse. Kuid teiega ei juhtu midagi. Need ei nakata teid.

Ma olen hakanud saame regulaarselt kirju inimestelt, kes on lasknud oma fekaale analüüsida ja saanud siis tulemused ning tõsiselt ehmatanud. Oh issand, mul on see paprikaviirus! Mis ma nüüd teen, ma pean arsti juurde minema. (Ja ma lisaks siia vahele, et arst naerab su välja aga toidulisandi ja imerohu müüja kabinetist tuled sa välja kilekotitäie kaubaga. Loodetavasti ei anna ma nüüd kellelegi head äriideed).

Ma ütlen, et ei, teil pole vaja kellegi juurde minna. Need viirused ei paljune meie kehas.

Paljud viirused on head. Ma nimetan neid kasulikeks viirusteks. Pildil vasakul on taimed, mis kasvavad kuumaveeallikate juures. 

Neid võib leida looduskaitsealadelt ja nad on kuumale vastupidavad. Võivad kasvada 55C juures. Ehk sa võid tuua selle taime laborisse ja kasvatada seda 55 C soojuses. Mingil hetkel avastati, et see taim on nakatunud seenega.  Kui aga seen taimedelt eemaldati, siis taimed ei suutnud enam kuumas kasvada. Kuidagi aitas seen kuumuse vastu kaitsta. Siis selgus, et selle seene sees oli viirus – seen oli nakatunud viirusega. Ja kui taimel oli seen aga viirust mitte, ka siis ei pidanud ta kuumale vast. Nii et viirus aitas. Siin toimis 3 vaheline side: taim-seen-viirus.

Veel üks äärmiselt põnev näide. Kas te olete kuulnud parasitoid wasp (kiletiivalised parasitoidid) nimelisest putukast? Nad munevad oma munad röövikute peale. Munad kooruvad, putuka vastsed söövad rööviku ära. Väga tulnukate filmi moodi, ainult et päris elust. Koos munadega aga laseb putukas endast välja ka viirused. Seda viirust nimetatakse polüdnaviiruseks ja see ei paljune rööviku peal. Kuid ta toodab valke, mis immunosupresseerib rööviku nii, et ta ei püüa munadest ega vastsetest  lahti saada. See viirus on hea putukale, kuid ei ole hea röövikule.

Selliseid näiteid on loodus täis.

Teine põhjus, miks paljud viirused meile midagi ei tee, on meie imeline immunsüsteem. Kui te olete immuunsupressiooni all – näiteks organi siirdamise korral. Samuti AIDS tekitab immuunasupressiooni ja ka näiteks leetrid tekitavad immuunsupressiooni. Sellisel juhul võib olla ka üsna ohutu viirushaigus surmaga lõppev. See näitab, kui oluline on meie immuunsüsteem.

Mitte kõik inimese viirused ei tee teid haigeks. Veel üks huvitav näide - polüomaviirus on viirus, mida leidub kõikjal maailmas. Me saame selle üsna varakult ja tavaliselt oma perekonna kaudu.  Viirus levib sülje ja hingamisteede kaudu. Kui olete sellega nakatunud, olete nakatunud kogu eluks. Kui te olete täiesti terved, siis te haigeks sellest ei jää. Samas, kui te olete immuunsupressiooniga, siis võib sellest areneda raske haigus. See viirus levib nii kergesti hingamisteede eritiste ja ka uriini kaudu. Milliliitris uriinis on tuhandeid viiruseosakesi. Ma ei taha muutuda paranoiliseks aga kui te külastate restorani tualettruumi, siis vett peale lastes, kerkib õhku mikroosakeste pilv.

Pildil olev katkendlik joon näitab, kuidas Homo sapiens liikus Aafrikast mujale. Ja must pidev joon näitab Homo sapiensi liikumist koos  infektsiooniga.

Hetkel on meil uus koroonaviirus ja selle ümber liigub palju hirmutavaid lugusid, mis kõik tulenevad informatsiooni puudusest.  Ma tahan teile näidata, kuidas seda informatsiooni leida ja et kui 2-3 aasta pärast tekib uus viirusepuhang, siis teil on see kursus meeles ja te saate aru, mis toimub.

Meil on täiuslik võimalus õppida, kuna ma juba mainisin – et uus koroonaviirus on ringi liikumas. Siin on nüüd mõned pealkirjad uudistest:

"Ärge minge Wuhani ja ärge lahkuge Wuhanist. Uus viirus võib muteeruda ja rohkem levida."

Ja siin on veel üks uudis Hiinast, et viirus võib muteeeruda ja levida.   

Nüüd sellel kursusel te saate teada, et see on vale. Viirustel ei teki millalgi võimalust muteeruda, vaid nad juba muteeruvad. Viirus muteerub iga kord, kui ta paljuneb. See on juba palju muteerunud, kui ta liigub ühelt inimeselt teisele.

Siin muidugi on tahetud silmas pidada võimalust, et muteerumise käigus tekib vorm, mis on võimeline kiiremini levima.

Kuid antud juhul nagu siin Hiina uudistes kirjutatakse, on pigem nii, et minister seda ei tea ja ajakirjandus korjab selle samamoodi üles ja nii jõuab see ka teieni.

Ja iga kord, kui tekib mingi uue viiruse puhang, tulevad täpselt samasugused pealkirjad – äkki võib viirus muteeruda. Ikka pole viiruste elu-olu põhialuseid selgeks saanud.

Mis siis on viirus? 

Ma olen igal aastal andnud viiruse definitsiooni erinevana. Selle aasta oma:

Viirus on nakkav, obligatoorne rakusisene parasiit, mis sisaldab geneetilist materjali, mis võib olla DNA või RNA, mida sageli ümbritseb valgukate ja mõnikord ka membraan.

Selle mõiste võiks nüüd lahti harutada. Nakkav tähendab seda, et viirus või liikuda peremehelt peremehele, rakust rakku ja sinna siseneda. Ja obligatoorne rakusisene tähendab seda, et ta peab pääsema rakku. Ta ei saa teisti paljuneda. Viirus ei saa paljuneda õhus või sinu naha pinnal – tal on vaja pääseda rakku. Parasiit tähendab, et ta kahjustab peremeesorganismi sellega, et võtab temalt näiteks toitaineid. Ta võtab ära toitaineid, mis oleks muidu teie kasutada. See tekitab natuke segadust, kuna me räägime hiljem veel sellest, et on viiruseid, mis teid nakatavad aga ei kahjusta. Kuid nad peavad midagi võtma, kuna selleks, et paljuneda nad peavad rakus paljunema. Vahel on aga see võtmine märkamatu ja ebaoluline.

DNA ja RNA viirused on unikaalsed ja neil võib olla nii üks, kui ka teine. Gripiviirusel on alati   RNA genoom  ja  herpese viirusel on alati DNA genoom.  Me räägime sellest lähemalt edaspidi.

Viirustel on valgukate. Enamikul viirustel on nukleiinhappe ümber valgukate ja me räägime sellest edaspidi samuti lähemalt.

Viirused peavad saama rakku siseneda ja paljuneda, muidu nad kaovad. Ma olen kindel, et paljud viirused on miljonite aasate jooksul kadunud. Nad pole suutnud leida peremeesorganismi.

Kui me uurime viirust, on meil vaja uurida ka peremeesrakku. Kõige iolulisemad avastused on tehtud, kui on uuritud viiruse poolt nakatatud rakku.

Sääsed võivad mudugi meid nakatada. Ja pildil on tulbid. Väga hinnalised tulbid, kuna neil on teist värvi triibud. Ja need triibud on põhjustatud viirusnakkusest.

Veel üks küsimus on, kas viirused on elus?

Oma blogis tegin sellekohase küsitluse ja te näete, et vastused on enam vähem võrdselt  jaotunud „elus“ ja „ei ole elus“ vahel. Midagi vahepeal on saanud ka palju klikke.  Mul on sellele küsimusel vastus aga see ei olegi nii lihtne.

Kui inimesed mõtlevad viirusest, siis sellisest, mis on pildil vasakul pool (polüomaviirus). Ja see ei anna kuidagi elava mõõtu välja. See on lihtsalt nukleiinhape valgust mantlis ja kui ma ta siia lauale panen, siis ta lihtsalt seisab siin ja ei tee mitte midagi. Ta ei saa ise paljuneda. Sestap see ei saa olla elus. Sel on võime paljuneda alles siis, kui ta satub raku sisse.

Viiruse osake, mida ma nimetan virioniks, ei saa olla elus.  Kui viirus aga satub rakku ja võtab raku üle ning rakk hakkab tootma viiruseosakesi, siis ei ole see lihtsalt rakk, vaid viirusest nakatunud rakk. Ja see on elus.

Nii et mina näen viirust kahefaasilise organismina: osakesena, mis ei ole elus ja nakatunud rakuna, mis on elus. See lahendab probleemi, kuigi inimestele ei meeldi tavaliselt sellised osalised lahendused. Inimestele meeldib viirusest mõelda, kui osakesest, mitte kui nakatunud rakust.

Mille eest ma teid hoiatada tahan – ärge antropomorfiseerige viirust. 

Antropomorfiseerimine - inimeste suundumus kanda  inimomadused üle mitte-inimestele ja objektidele. See võib väga kergesti juhtuda, kuna nii on neist kergem rääkida ja ajakirjandus kasutab selliseid asju palju: viiruse eesmärk on selline; viirus tahab teha seda ja toda...

Ei, neil ei ole eesmärki nad ei taha ega mõtle. Nad on passiivsed osakesed ja kui te neid antropomorfiseerite, siis võite neid kergesti valesti tõlgenda.

Kunagi oli mul viiruste mõiste juures ka suurus. Viirused on väga, väga väikesed ja ma ütlesin, et nad ei läbiks 0,2 mikronist sõela. Kuid nüüd on leitud palju suuremaid viiruseid - 1,5 mikroniseid. Ja ma ei saa seda enam kasutada.
Allolevast graafikust näete, millises suurusjärgus on viirused.Ja kui suured on viirused võreeldes rakuga.



Kui teil on küsimus, kui palju viiruseid mahub nööpnõelapea otsa, siis siin  on illustreeriv pilt:




2mm on võrdne 2000 mikroniga ja sinna mahub 500 miljonit rhinoviirust. Suurendatud pildil on hästi äratuntavad punased verelibled, kuid viirus on see kõige pisem, peaaegu märkamatu  pikk ribake.